Mejor programa de facturación para autónomos en 2026: Quipu, Holded, Quaderno o la app gratis de la AEAT

La respuesta corta: no hay un único mejor programa de facturación para autónomos, hay uno mejor según cómo trabajes. Si facturas poco y casi siempre a empresas, la aplicación gratuita de la AEAT puede bastarte y no pagas nada. Si quieres facturas, contabilidad e impuestos juntos y eres autónomo en España, Quipu. Si vendes online a clientes de otros países, Quaderno. Si el negocio crece y quieres verlo todo en un panel, Holded. Y hay un filtro que va antes que todos: que cumpla con Verifactu, porque desde el 1 de julio de 2027 será obligatorio para autónomos. Aquí te los comparo con precios reales de sus webs, sin humo.

Los precios los he sacado de las páginas oficiales el 19 de septiembre de 2026 y cambian a menudo, así que confírmalos antes de contratar. Para tu caso concreto, pregunta a tu gestor (o a una gestoría online), que muchas veces ya trabaja con un programa concreto. Puede haber enlaces de afiliado: si en algún momento contratas a través de uno, SoloConIA podría llevarse una comisión sin coste extra para ti.

Antes de elegir: que cumpla con Verifactu

Este es el filtro que no puedes saltarte. Desde el 1 de julio de 2027 los autónomos solo podrán facturar con un programa de facturación que cumpla los requisitos de Verifactu, así que si eliges uno ahora, que sea de los que ya lo cumplen y te evitas migrar después. Los cuatro de esta guía lo cumplen o lo declaran en su web. Si no tienes claro qué es Verifactu, quién está exento o qué multa hay, lo explico en Verifactu para autónomos; y si lo que te confunde es la factura electrónica obligatoria de la Ley Crea y Crece, que es otra norma y llega después, lo aclaro en Verifactu y factura electrónica: no son lo mismo. Con ese filtro puesto, la elección va según lo que necesites.

Comparativa rápida: Quipu, Holded, Quaderno y la app de la AEAT

No he usado a fondo los cuatro, así que esto es una tabla de hechos sacada de sus webs oficiales, no una puntuación. Los precios son el importe mensual sin promoción; abajo detallo descuentos y letra pequeña.

Quipu: el más completo para el autónomo español

Quipu está pensado justo para el autónomo de aquí: junta la facturación, la contabilidad y el control de impuestos en un sitio, con lectura automática de tickets y facturas y conexión con tu banco para cuadrar los movimientos. Si quieres que una sola herramienta te lleve las facturas y te prepare los modelos de impuestos, es de las más redondas para trabajar solo en España. Su enfoque es fiscal-contable, más que de gestión de empresa, y ahí es donde brilla.

Sus precios, según su página de planes: Starter 8,5 €/mes, Solution 15 €/mes y Premium 29,5 €/mes, pero esos son los importes con el 50% de descuento de los tres primeros meses. Después vuelven a 17, 30 y 59 €/mes. Si pagas el año entero, la misma página dice que "Al contratar el servicio anualmente se paga solo por 10 meses" (168, 300 y 588 €/año). Hay 15 días de prueba. Un detalle que decide el plan: el Starter incluye 30 escaneos al mes del lector de tickets; si vas a subir muchos gastos, el Solution sube a 250. El análisis a fondo lo tienes en Quipu para autónomos.

Holded: todo en uno si el negocio crece

Holded es más que facturación: es una plataforma de gestión (un ERP) que junta facturas, contabilidad, CRM, proyectos y equipo en un mismo sitio. Está pensada para cuando el negocio deja de ser solo tú y una hoja de facturas, y quieres verlo todo desde un panel. Para un autónomo que empieza puede ser más de lo que necesita, pero si prevés crecer o llevar más cosas que solo facturar, es la que mejor te acompaña según escalas.

Sus precios, según su página de precios: "Holded cuesta desde 15 € al mes con el plan Plus", y esa misma página aclara que "El resto de planes son Básico (29 €), Estándar (59 €), Avanzado (99 €) y Premium (199 €), IVA no incluido". Los tres primeros meses van al 50% y hay 14 días de prueba sin tarjeta. La letra pequeña está en los topes: el plan Plus incluye 250 facturas al año, el Básico 1.000 y el Estándar 3.000. Y varias cosas que en Quipu vienen dentro aquí son módulos aparte (nóminas, inventario, TPV, conexión con el SII). Para un autónomo que factura a diario, el Plus se queda corto pronto y el Básico a 29 € más IVA es el punto de entrada realista.

Quaderno: el mejor si vendes online y a otros países

Si tu negocio es una tienda online, sobre todo si vendes a clientes de otros países, Quaderno resuelve la facturación para tienda online que los demás no: automatiza el IVA de las ventas internacionales, se conecta con Stripe, PayPal, Shopify o WooCommerce y emite las facturas solo, aplicando el impuesto correcto según el país del cliente. Para quien vende fuera y tiene que lidiar con el IVA europeo y la ventanilla única, es el que más tiempo y errores te ahorra. Y sí cumple con la normativa española: su página de Verifactu dice que "Quaderno genera, administra y envía facturas electrónicas de forma automática cumpliendo con Verifactu".

Sus precios, según su página de precios: Hobby 29 al mes con 25 operaciones, Startup 49 con 250, Business 99 con 1.000 y Growth 149 con 2.500. La página no muestra el símbolo de la moneda, así que comprueba en el registro en qué divisa te cobra. Cobra por volumen de operaciones, no por usuarios, y su web avisa de que si superas el límite del plan te sube automáticamente al siguiente. Hay 7 días de prueba. Si vendes solo en España, quizá te sobre; si vendes fuera, es su terreno. El análisis a fondo lo tienes en Quaderno para vender online.

¿Hay programas de facturación gratis? La app de la AEAT frente a Quipu y Holded

Sí, y viene de donde menos se espera: de la propia Agencia Tributaria. Su aplicación gratuita VERI*FACTU emite facturas que ya cumplen todo, sin límite de facturas, entrando con Cl@ve o certificado. Lo que te quita es lo que un programa de pago te da, y conviene verlo en frío antes de decidir:

• Tickets: la app no los emite. La ficha de la AEAT avisa de que "Todas las facturas deben incluir obligatoriamente un destinatario por lo que no es posible emitir facturas simplificadas (tickets)". Si vendes a particulares en una tienda online, esto solo ya te manda a Quipu, Holded o Quaderno.
• Salir después: según la misma ficha, "No es posible exportar registros para continuar la facturación en otro sistema informático de facturación". Empiezas gratis y, si en un año necesitas más, te llevas PDFs sueltos, no un histórico importable.
• Todo lo que no es la factura: gastos, conciliación con el banco, previsión de impuestos, modelos trimestrales, recordatorios de cobro. La app hace la factura y la envía a Hacienda; el resto sigue siendo tu Excel y tu gestor.

Mi lectura: si emites pocas facturas al mes, a empresas o profesionales con NIF, y ya tienes gestor para los impuestos, la app de la AEAT es la respuesta honesta a "programa de facturación gratis para autónomos" y no hay motivo para pagar 17 € al mes. En cuanto vendes a particulares, facturas a diario o quieres que gastos e impuestos vivan en el mismo sitio, el precio de Quipu o Holded se paga solo en horas ahorradas. Las opciones de código abierto existen, pero tú cargas con instalarlas, mantenerlas y comprobar que el fabricante publique la declaración responsable de cumplimiento de Verifactu; para un autónomo que trabaja solo, rara vez compensa.

¿Quipu o Holded para un autónomo?

Es una de las comparaciones más buscadas y la diferencia es de enfoque, no de calidad:

• Quipu parte de la fiscalidad del autónomo español: factura, gasto, banco e impuestos. El plan de entrada vale 17 €/mes sin promoción (8,5 € los tres primeros meses) y trae la previsión de impuestos dentro.
• Holded parte de la gestión de empresa: factura, contabilidad, CRM, proyectos, equipo. El plan de entrada vale 15 €/mes más IVA, pero con 250 facturas al año; el siguiente escalón real son 29 € más IVA.

Regla rápida: si tu pregunta es "quiero dejar de pelearme con el 303 y el 130 y tener las facturas ordenadas", Quipu. Si tu pregunta es "quiero un sitio donde vivan mis clientes, mis proyectos, mi facturación y mi contabilidad, y sé que voy a crecer", Holded. Si dudas, empieza por Quipu: es más barato de abandonar, porque cuando necesites un ERP lo sabrás sin que nadie te lo explique.

¿Cuánto cuesta un programa de facturación para autónomos?

Con los precios oficiales de septiembre de 2026 en la mano, la horquilla real para un autónomo que trabaja solo es esta: 0 € con la app de la AEAT, 15 a 17 € al mes por el plan de entrada de Holded o Quipu (la mitad los tres primeros meses en ambos), y 29 a 30 € al mes por el plan que ya trae contabilidad automática y banco sin topes cortos. Quaderno va aparte porque cobra por operaciones y no compite en el mismo uso. Dos avisos: el precio que ves en grande es casi siempre el de la promoción, así que haz números con el importe al que vuelve al cuarto mes; y mira si es con o sin IVA, porque Holded lo dice claro (no incluido) y otros no lo indican en la tabla.

Entonces, ¿cuál es el mejor programa de facturación para autónomos según tu caso?

Por tipo de negocio, esto es lo que yo miraría:

• Facturas poco y a empresas, y ya tienes gestor: la app gratuita de la AEAT.
• Autónomo en España que quiere facturas, gastos e impuestos juntos: Quipu.
• Negocio que crece y quieres gestionarlo todo en un sitio: Holded.
• Vendes online a clientes de otros países: Quaderno.

Elijas la que elijas, dos reglas: que cumpla con Verifactu y que no pagues por funciones que no vas a usar. Y recuerda que esto va de la mano de estar dado de alta como autónomo y de hacer bien cada factura de las ventas que cobras con tu pasarela de pago. El mejor programa de facturación para autónomos es el que encaja con cómo facturas tú, no el que más funciones tiene. Y si quieres automatizar lo que rodea a esas facturas (avisos, recordatorios, lectura de gastos con IA), estos programas tienen API para conectarlos, como cuento en automatizar la facturación con n8n.

Preguntas frecuentes

¿Cuál es el mejor programa de facturación para un autónomo?

Depende de tu caso. La app gratuita de la AEAT si facturas poco y a empresas; Quipu si quieres facturación, contabilidad e impuestos juntos en España; Holded si el negocio crece y quieres gestionarlo todo en un sitio; Quaderno si vendes online a otros países. En todos, lo primero es que cumpla con Verifactu.

¿Qué programa de facturación gratis cumple con Verifactu?

La aplicación gratuita de la Agencia Tributaria, disponible en su Sede. Emite facturas que cumplen Verifactu sin límite de número, pero no emite tickets ni facturas simplificadas, no exporta los registros a otro programa y no lleva gastos ni impuestos. Para el resto de opciones gratuitas, comprueba que el fabricante publique su declaración responsable de cumplimiento.

¿Quipu o Holded para un autónomo?

Quipu si lo que quieres es orden fiscal: facturas, gastos, banco e impuestos, desde 17 €/mes sin promoción. Holded si quieres una plataforma de gestión completa (CRM, proyectos, equipo) y prevés crecer, desde 15 €/mes más IVA con 250 facturas al año, o 29 € más IVA sin ese tope tan corto. Ambos cumplen con Verifactu.

¿Cuánto cuesta un programa de facturación para autónomos?

Según las webs oficiales en septiembre de 2026: 0 € la app de la AEAT, 15 a 17 €/mes el plan de entrada de Holded o Quipu (la mitad los tres primeros meses), y 29 a 30 €/mes el plan con contabilidad y banco sin topes cortos. Quaderno cobra por operaciones, desde 29 al mes con 25 operaciones.

¿Necesito un programa de facturación compatible con Verifactu?

Sí, desde el 1 de julio de 2027 para autónomos. Desde esa fecha solo se podrá facturar con un programa que cumpla los requisitos de Verifactu, así que si eliges uno ahora, elígelo ya compatible para no cambiar después.

¿Qué diferencia hay entre Quipu, Quaderno y Holded?

Quipu es fuerte en facturación, contabilidad e impuestos para el autónomo español; Quaderno está enfocado a la facturación para tienda online con IVA internacional; Holded es una plataforma de gestión todo en uno para negocios que crecen. Los tres cumplen con Verifactu según sus webs; elige el programa de facturación para autónomos que encaje con tu caso.